Государственную регистрацию судов внутреннего плавания и судов смешанного (река – море) плавания осуществляет орган по безопасности судоходства.
Государственную регистрацию маломерных судов, за исключением гребных лодок, байдарок и надувных судов грузоподъемностью менее 225 килограммов, осуществляет Государственная инспекция по маломерным судам.